经过漫长的旅途，小金他们一行五人，来到了一个嘉年华节，他们打算好好玩一玩。正当小智和小刚在跳舞时，小霞发现了魔术师马健，一个刚刚被助手抛弃的魔术师。被再三请求后，小霞当了马健的助手，可是他的魔术过于糟糕以致被老板开除。为了使马健重拾信心，小智等人想尽办法帮助他，在椰蛋树军团大前进，它帮助战胜了许多的椰蛋树，进化成了火恐龙。

    但是小金知道火恐龙开始不听小智的命令了，除了小智作为训练家的实力太低，还有就是小火龙过去遗留的心理问题并没有完全解决。如果小智是从一开始就是小火龙的训练家，进化成火恐龙也不会这么不听训练家的命令。

    小火龙原本的训练家叫做大佑，由于大佑嫌小火龙太弱，连蚊香蝌蚪都打不赢。因此大佑想抛弃它，但丢了好几次又跟回来，所以，大佑便告诉小火龙让它在岩石上乖乖地等他回来，大佑离开了就不再回来了。还在神奇宝贝中心里侮辱被自己抛弃的小火龙，引起小智一行人的愤怒。当他知道自己的小火龙变强了，学会了新的绝招时，想来接它，但是，小火龙却不再承认这个主人，并对强行使用精灵球想要收服它的大佑使出喷射火焰。

    由于小智在小火龙最危险的时候守住了它尾巴上的火焰，小火龙便来报恩，从火箭队三人组手上夺回小智的皮卡丘。当小火龙听到大佑说出实情时，十分伤心，决定不再跟随大佑，而跟随小智。

    而现在小智的火恐龙打倒了近百只椰蛋树，一时间获得了大量的经验，进化后就直接拥有了精英后期的实力，也许是过去抛弃它训练家大佑的影响还在，火恐龙认为自己的实力已经不再需要训练家的帮助，所以才会导致火恐龙性格大变。

    不过虽然火恐龙不再听小智的命令，但是他们之前的记忆还在，所以火恐龙心底还是很关心小智的，不然也不会在小智危险的时候站出来。

    离开了嘉年华，小金他们一行五人来到了附近的小山村，小刚看了一下地图原来是松藻镇附近。

    而另一边火箭队的喵喵也因为发烧而难以行动，就在武藏和小次郎打算抛弃喵喵时，清美出现并给喵喵服下了药，让喵喵病情缓解了。这让喵喵迷上了清美，它想成为清美店里的招财猫。

    清美和她的奶奶在松藻镇经营一家神奇宝贝药店——汉方堂。小金一行人因为采购药品来到了清美的店里。开汉方堂的清美拥有一只派拉斯，她希望自己的派拉斯能够早日进化为派拉斯特，这样可以给她提供可以用来当作药材的蘑菇，这样她可以制造出能够提升神奇宝贝能力的药品。

    清美于是拜托来店里买药的神奇宝贝训练家小金一行人给派拉斯特训以让其进化。小智首先站了出来表示一定会帮忙。

    而小金表示自己就有一只派拉斯特，可以给清美提供一些派拉斯特的蘑菇。清美非常的惊喜，但是想到小金的派拉斯特毕竟很快就会离开，而做神奇宝贝药物的研究可不是一点点的蘑菇就可以研究出来，需要大量的实验以及分析，这样就需要消耗大量的蘑菇，所以还是拜托他们一定要让自己的神奇宝贝派拉斯进化。

    但是这只派拉斯不仅弱，而且弱的令人发指，还十分胆小。

    最开始就连皮卡丘向靠近它打招呼，派拉斯都会吓得躲开。刚开始战斗，皮卡丘很轻松的躲过了派拉斯的麻痹粉。接着，在小智的命令下，皮卡丘仅用十伏特攻击了派拉斯，但派拉斯还是倒下了。

    接着，小智派出了属性上占劣势的杰尼龟，并且用了很弱的水枪攻击，但派拉斯还是倒下了。最后，小智派出了火恐龙，但在火恐龙不顾命令的全力攻击下，派拉斯吓得逃走了。

    之后，喵喵找到了派拉斯。为了讨好清美，喵喵拉着武藏和小次郎一起给派拉斯做特训。喵喵故意让阿柏怪、双弹瓦斯和自己输给派拉斯，这让派拉斯得到了经验以及自信。

    接着，小金一行人找到了派拉斯，派拉斯主动挑战了皮卡丘。皮卡丘故意输给了派拉斯后，小智再次派上了火恐龙，虽然火恐龙仍然不听指挥地全力攻击，但是派拉斯无意间攻击了火恐龙的肚子，将火恐龙打晕。紧接着，派拉斯进化成了派拉斯特。重新站起来的火恐龙仍想打，但是被派拉斯特的蘑菇孢子催眠了。

    这里小金认为小智的火恐龙是为了帮助小智才故意输的，不然这么弱的派拉斯轻轻的一抓怎么可能打败火恐龙。然后，当派拉斯进化为派拉斯特后，火恐龙认为进化后的派拉斯特应该实力不错，才想要继续神奇宝贝对决。

    小金将自己的派拉斯特也放了出来，没想到自己的派拉斯特竟然对清美刚刚进化的派拉斯特一见钟情。小金的派拉斯特眼睛完全变成了爱心状，来到清美刚刚进化的派拉斯特不停地蹭着。

    与你一见如故，是我今生最美丽的相遇。

    与你一诺相许，是我素色年华里最永恒的风景。

    一直想说，无论走到哪里，最想去的是你的身边。

    愿我们彼此相爱，一直到时间的尽头。

    我相信我们可以一起，等青丝变白发。

    你在，我在，就是海枯石烂。

    没有过多的华丽，只有一句我喜欢你，却能让彼此牵挂于心。

    亲爱的，你知道吗，哪怕遍体鳞伤，我仍有爱你的余力。

    有的人你只看了一眼，却影响其一生。

    而清美刚刚进化的派拉斯特看到如此强大的雄性如此痴迷自己，也是接受的小金的派拉斯特的求爱。

    然后，小金对派拉斯特和清美说：“我的派拉斯特好像喜欢上你的派拉斯特了。但是这段时间我的派拉斯特还有参加联盟大赛，等比赛一完，我会把他送到这里，这样他们就可以一起快乐的生活了。今后，我的派拉斯特就拜托清美小姐照顾了。”

    “不必客气，你把派拉斯特留给我，对我的研究帮助很大。我反而需要感谢你。”清美笑眯眯地摆了摆手。

    最后，被小智的火恐龙打伤的火箭队再次被清美所救，就在喵喵求清美让自己留下来当招财猫时，清美的奶奶在汉方店的后山抓到了一只猫老大，于是将其当成了店铺的招财猫。清美表示会将猫老大当成喵喵一样好好照顾它，但是喵喵却因为再次输给猫老大而感到十分伤心。